De la célula al tejido: claves para analizar datos de single-cell y spatial
Un recorrido práctico por las etapas esenciales del análisis de single-cell RNA-seq y transcriptómica espacial, desde el control de calidad hasta la interpretación biológica de los resultados. Iremos más allá de las herramientas de 10x Genomics con ejemplos de análisis complementarios para sacar el máximo partido a tus datos.
PonenteQuién lo imparte
María José Jiménez Santos, PhD
Cofundadora · Azura Biosciences
Doctora en Bioinformática con más de cinco años de experiencia en genómica del cáncer. Especializada en oncología de precisión, priorización de fármacos y análisis de datos de transcriptómica single-cell y espacial, desarrolla herramientas computacionales para avanzar hacia tratamientos personalizados. Formada en la Unidad de Bioinformática del CNIO, donde nació Azura.
Qué veremos
Las tecnologías de single-cell y spatial permiten estudiar la biología con un detalle sin precedentes: identificar poblaciones celulares, detectar cambios entre condiciones y situarlos en el tejido. Pero el valor de un experimento depende de que el análisis se haga bien y se interprete correctamente. Recorreremos las etapas clave de cada tecnología, en orden.
Single-cell RNA-seq
- 01Control de calidadFiltrado de células y genes, dobletes, contaminación ambiental.
- 02Anotación de tipos celularesMarcadores, referencias y cómo validar lo que sale.
- 03Integración de muestrasCorregir efecto lote sin borrar la biología.
- 04Comparación entre condicionesCambios de composición y de expresión, con la estadística adecuada.
Transcriptómica espacial
- 05Segmentación espacialDe spots o células a regiones y dominios del tejido.
- 06DeconvoluciónEstimar la composición celular de cada spot con referencias single-cell.
- 07Vecindades e interaccionesQuién está cerca de quién y qué se dicen.
Complementariedad entre tecnologías. Cerraremos viendo cómo single-cell y spatial responden a preguntas distintas y cómo combinarlas en un mismo proyecto para que cada una cubra lo que la otra no ve.
Para quién es
- Investigadores que están planificando o ya tienen datos de single-cell o spatial.
- Personal técnico y responsables de plataformas de genómica.
- Profesionales de la biomedicina interesados en aplicar estas tecnologías en sus proyectos.
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10:00 h (hora española) · 45 minutos · Online · En español · Con Bonsai Lab